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版纳植物园樟科植物叶绿体比较基因组学研究获进展

版纳植物园樟科植物叶绿体比较基因组学研究获进展

  楠木是中国传统的名贵木材之一,主要来源于樟科润楠-鳄梨属群树种。然而,这一属群各属内部的种间关系尚不明晰。继润楠属和鳄梨属叶绿体基因组研究报道之后,中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组研究人员以分布于我国南部地区的紫楠(Phoebe sheareri (Hemsl.) Gamble)和四川盆地的峨眉楠(Phoebe omeiensis R.H. Miao)为实验材料,通过长链PCR和二代测序技术完成了叶绿体基因组进行全覆盖测序。

  通过比对发现,樟科楠属植物的叶绿体基因组大小约为153kb,与近缘属润楠属韩式1.5分彩开户和鳄梨属植物相似;两个楠木叶绿体基因组共有222个突变位点,包括146次替换事件、73次插入缺失事件和3次小倒位事件;突变位点在叶绿体基因组上呈现非随机性分布,共有38个聚集区。基于该研究结果,研究人员对楠属植物叶绿体基因组的基因和结构进行比较,定位突变位点,并利用高变区域构建进化树,明确了十二种国产楠属植物的亲缘关系。研究结果再次证实了樟科植物叶绿体基因组存在种间遗传差异小的事实,明确了樟科植物叶绿体基因组的高聚集区序列与传统分析序列不同,并初步划定了国产楠属植物的四个主要分组。

  相关研究成果以Comparative 韩式1.5分彩开奖结果 analysis of complete chloroplast genome sequences of two subtropical trees, Phoebe sheareriand Phoebe omeiensis (Lauraceae)为题,在线发表在Tree Genetics & Genomes上。研究工作得到了国家自然科学基金委,中科院“西部之光”和千人计划等的资助。韩式1.5分彩开户

  论文链接 

楠属植物叶绿体基因组

紫楠(Phoebe sheareri (Hemsl.) Gamble)和峨眉楠(Phoebe omeiensis R.H. Miao)